一个国际科学家团队收集了黑莓基因组的第一个完整序列，创造了遗传工具，这将有助于指导水果育种者开发具有改进风味、耐寒性和其他理想特性的新品种。
阿肯色州农业试验站（阿肯色大学系统农业部门的研究机构）的副教授和水果育种师Margaret Worthington说，这个项目产生了第一个染色体长度的黑莓基因组的组装和注释。
精选浆果
沃辛顿与一个由来自七个国家的26名研究人员组成的团队合作，他们共同组装了希尔奎斯特的基因组，Hillquist 是一种野生黑莓，具有独特的果实习性，由弗吉尼亚州阿什兰的一名园丁H.L.希尔奎斯特在1949年发现。
阿肯色大学系统农业部门于2004年发布了第一个初生果品种Prime-Jim®和Prime-Jan®。该部门发布的21个黑莓品种中有6个是初果期品种。
根据研究论文中引用的《2022年农产品市场指南》的数据，2020年美国人在黑莓上的花费超过了6.56亿美元。
该小组对Hillquist黑莓进行了测序，并将这些碎片组装成完整的染色体。然后，科学家们检查了基因组，以建立一个精确的结构注释--确定构成基因的每个DNA序列的精确位置。他们还开发了一个功能注释--根据作为模型的其他植物中类似基因的作用，对每个基因的可能功能进行描述。
完成的基因组已经证明对农业司的育种计划有帮助。"沃辛顿说："从那时起，我们已经将基因组用于很多事情。"我们已经有几篇研究论文正在进行中，这些论文来自于这个组合。
她说，黑莓基因组为沃辛顿的研究小组提供了一个起点，在此基础上他们能够开发数以千计的分子标记，并首次在黑莓中进行全基因组关联研究。
全基因组关联研究是对同一物种的大量个体的遗传变异的观察分析。其目的是确定与特定性状有统计学联系的基因。由此产生的信息具有广泛的应用，包括估计植物中理想性状的遗传性。
